Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Actn1Q7TPR4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Actn1Q7TPR4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Actn1Q7TPR4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms