Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc39a4Q78IQ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc39a4Q78IQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms