Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SpopQ6ZWS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SpopQ6ZWS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpopQ6ZWS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpopQ6ZWS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms