Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnot1Q6ZQ08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cnot1Q6ZQ08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnot1Q6ZQ08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cnot1Q6ZQ08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms