Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tfap2eQ6VUP9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2eQ6VUP9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2eQ6VUP9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms