Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AY358078Q6UY53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AY358078Q6UY53 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AY358078Q6UY53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms