Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clca4aQ6Q473 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clca4aQ6Q473 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clca4aQ6Q473 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clca4aQ6Q473 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms