Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Gapvd1Q6PAR5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Gapvd1Q6PAR5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Gapvd1Q6PAR5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Gapvd1Q6PAR5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Gapvd1Q6PAR5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms