Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmd5Q6P5H6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmd5Q6P5H6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd5Q6P5H6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd5Q6P5H6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms