Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gga2Q6P5E6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga2Q6P5E6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga2Q6P5E6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga2Q6P5E6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms