Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kdm2bQ6P1G2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm2bQ6P1G2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm2bQ6P1G2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm2bQ6P1G2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms