Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpbp1l1Q6NZP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpbp1l1Q6NZP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms