Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc66Q6NS45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc66Q6NS45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc66Q6NS45 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc66Q6NS45 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms