Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt77Q6IFZ6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt77Q6IFZ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt77Q6IFZ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt77Q6IFZ6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms