Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp7Q6A4J8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp7Q6A4J8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp7Q6A4J8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp7Q6A4J8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms