Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cep290Q6A078 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep290Q6A078 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8987.7 ms