Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt12Q64291 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt12Q64291 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt12Q64291 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms