Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlh2Q64221 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh2Q64221 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlh2Q64221 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms