Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms