Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20854Q62461 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm20854Q62461 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm20854Q62461 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm20854Q62461 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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