Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha6Q62413 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha6Q62413 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha6Q62413 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha6Q62413 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms