Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim28Q62318 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim28Q62318 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim28Q62318 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim28Q62318 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms