Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Gli3Q61602 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Gli3Q61602 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Gli3Q61602 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30,95■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30,95■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Gli3Q61602 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gli3Q61602 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,3 ms