Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik1Q60934 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik1Q60934 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik1Q60934 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik1Q60934 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms