Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dnajc11Q5U458 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnajc11Q5U458 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnajc11Q5U458 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnajc11Q5U458 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dnajc11Q5U458 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms