Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vmn1r196Q5SVD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms