Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TefmQ5SSK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TefmQ5SSK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TefmQ5SSK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms