Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf215Q5SPX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf215Q5SPX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf215Q5SPX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf215Q5SPX3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms