Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phactr4Q501J7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Phactr4Q501J7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms