Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

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Length 63 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm6040Q4QY32 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm6040Q4QY32 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm6040Q4QY32 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm6040Q4QY32 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm6040Q4QY32 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm6040Q4QY32 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms