Protein–RNA interactions for Protein: Q4QY32

Gm6040, Beta-defensin 51, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6040Q4QY32 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6040Q4QY32 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6040Q4QY32 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms