Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18,41■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18,41■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,4■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,54
1700057G04RikQ3V0U0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,39■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18,38■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18,38■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,38■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,37■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
1700057G04RikQ3V0U0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18,33■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,32■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18,29■□□□□ 0,52
1700057G04RikQ3V0U0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,1 ms