Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nek10Q3UGM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek10Q3UGM2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek10Q3UGM2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms