Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam35aQ3UEN2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam35aQ3UEN2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam35aQ3UEN2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms