Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem109Q3UBX0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem109Q3UBX0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem109Q3UBX0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem109Q3UBX0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms