Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf180Q3U827 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf180Q3U827 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf180Q3U827 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf180Q3U827 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
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