Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc17a7Q3TXX4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc17a7Q3TXX4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc17a7Q3TXX4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms