Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
InipQ3TXT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
InipQ3TXT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InipQ3TXT3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms