Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
9130409I23RikQ3TS87 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
9130409I23RikQ3TS87 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9130409I23RikQ3TS87 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms