Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax1Q2NKI2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax1Q2NKI2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vax1Q2NKI2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms