Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q149G0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q149G0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q149G0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q149G0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q149G0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q149G0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q149G0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q149G0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q149G0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q149G0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q149G0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q149G0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q149G0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q149G0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q149G0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q149G0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q149G0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q149G0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q149G0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q149G0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q149G0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q149G0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q149G0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q149G0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q149G0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q149G0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q149G0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q149G0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q149G0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q149G0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q149G0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q149G0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q149G0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q149G0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q149G0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q149G0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q149G0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q149G0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q149G0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q149G0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q149G0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q149G0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q149G0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q149G0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q149G0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q149G0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q149G0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q149G0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms