Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpusd2Q149F1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpusd2Q149F1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpusd2Q149F1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpusd2Q149F1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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