Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samd12Q0VE29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd12Q0VE29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms