Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb8Q0VBD0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb8Q0VBD0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb8Q0VBD0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms