Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col10a1Q05306 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col10a1Q05306 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col10a1Q05306 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms