Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcn1Q05186 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rcn1Q05186 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcn1Q05186 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms