Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox9Q04887 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox9Q04887 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sox9Q04887 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms