Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Emx2Q04744 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Emx2Q04744 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Emx2Q04744 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Emx2Q04744 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms