Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Msx2Q03358 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msx2Q03358 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Msx2Q03358 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Msx2Q03358 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms