Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hivep1Q03172 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hivep1Q03172 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hivep1Q03172 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms