Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb5Q02739 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb5Q02739 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb5Q02739 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms